Cărți:

1. Proba Infernului. Personalul de cult în sistemul carceral din România potrivit documentelor Securităţii, 1959-1962, Bucureşti, Editura Scriptorium, 2004, XXXVI + 155 pp. (editor). ISBN 973-86983-2-4.
2. Ţărănimea şi puterea. Procesul de colectivizare a agriculturii în România (1949-1962), Cuvânt înainte de Gail Kligman şi Katherine Verdery, Iaşi, Editura Polirom, 2005, 502 pp. (editor împreună cu Constantin Iordachi). ISBN 973-681-800-4.
3. Raportul final al Comisiei Prizidenţiale pentru Analiza Dictaturii Comuniste din România, Bucureşti, Monitorul Oficial, 2006, 665 pp. (coautor şi coeditor); Comisia Prezidenţială pentru Analiza Dictaturii Comuniste din România, Raport Final, ediţie revăzută şi îmbunătăţită, Bucureşti, Editura Humanitas, 2007, 879 pp. (coautor; editor împreună cu Vladimir Tismăneanu şi Cristian Vasile). ISBN 978-973-50-1836-8.
4. O istorie a comunismului din România. Manual pentru liceu, Iaşi, Editura Polirom, 2008, 192 pp. ISBN 978-973-46-1147-8; ediţia a II-a revăzută, Iaşi, Editura Polirom, 2009, 192 pp. ISBN 978-973-46-1359-5; ediţia a III-a, Iaşi, Editura Polirom, 2014, 192 pp. ISBN 978-973-46-4149-9 (coautor împreună cu Mihai Stamatescu, Raluca Grosescu, Andrei Muraru, Liviu Pleşa şi Sorin Andreescu).
5. Listele morţii. Deţinuţi politici decedaţi în sistemul carceral din România potrivit documentelor Securităţii, 1945-1958, Iaşi, Editura Polirom, 2008, 240 pp. (editor). ISBN 978-973-46-1186-7.
6. Transforming Peasants, Property and Power. The collectivization of agriculture in Romania, 1949–1962, Budapest, New York, Central European University Press, 2009, 530 pp. (coeditor împreună cu Constantin Iordachi). ISBN 978-963-9776-25-8.
7. Istoria comunismului din România. Documente. Perioada Gheorghe Gheorghiu-Dej (1945-1965), Bucureşti, Comisia Prezidenţială pentru Analiza Dictaturii Comuniste din România, Editura Humanitas, 2009, 848 pp. (coeditor împreună cu Mihnea Berindei şi Armand Goşu). ISBN 978-973-50-2455-0.
8. Ghidul Arhivelor Naţionale ale României, [Bucureşti], Arhivele Naţionale ale României, 2009, 120 pp. (co-editor împreună cu Şerban Marin şi Andrei Muraru). ISBN 973-973-8308-42-8.
9. Istoria comunismului din România, volumul II, Documente Nicolae Ceauşescu (1965-1971), Iași, Editura Polirom, 2012, 704 pp. (coeditor împreună cu Mihnea Berindei şi Armand Goşu; Comisia Prezidenţială pentru Analiza Dictaturii Comuniste din România). ISBN print 978-973-46-2553-6; ISBN ePub 978-973-46-2850-6.
10.  Refugiații polonezi în România, 1939-1947. Documente din Arhivele Naționale ale României/Polscy uchodźcy w Rumunii 1939–1947. Dokumenty z Narodowych Archiwów Rumunii, ediţie bilingvă (română-poloneză), Varșovia-București, Arhivele Naționale ale României, Institutul Memoriei Naţionale – Comisia pentru Condamnarea Crimelor Împotriva Natiunii Poloneze, Institutul de Investigare a Crimelor Comunismului şi Memoria Exilului Românesc, 2013, vol. I-II, 1576 p. + 32 p. foto (inițiator al proiectului și coeditor împreună cu Florin Anghel, Cristian Aniţa, Jerzy Bednarek, Elena Cârjan, Margarita Chilińska, Wanda Chudzik, Tadeusz Dubicki, Claudia Grigoraş, Łukasz Kamiński, Janusz Kurtyka, Rafał Leśkiewicz, Marcin Majewski, Stejărel Olaru, Marius Oprea, Gabriela Preotesi). ISBN 978-83-7629-397-4.

Rapoarte instituționale

1. Arhivele Naţionale ale României, Raport de activitate – 2007, Arhivele Naţionale ale României, 2008, 112 pp. (coordonator împreună cu Şerban Marin). ISBN 973-973-8308-36-7.
2. Arhivele Naţionale ale României. Raport de activitate – 2008, Arhivele Naţionale ale României, 2009, 128 pp. (coordonator împreună cu Şerban Marin). ISBN 973-973-8308-40-4.
3. Centrul de Studii asupra Comunismului şi Postcomunismului. Raport de activitate: 2007-2009, Iaşi, 2009, 30 pp. (co-editor împreună cu Ovidiu Buruiană, Andrei Muraru şi Alexandru Muraru)

Reviste editate

1. Archiva Moldaviae [Iaşi], vol. I, 2009, 480 pp. (editor-in-chief). ISSN 2067-3930. [revista are proceduri de tip peer review].
2. Archiva Moldaviae [Iaşi], vol. II, 2010, 466 pp. (editor-in-chief).
3. Archiva Moldaviae [Iaşi], vol. III, 2011, 478 pp. (editor-in-chief).
4. Archiva Moldaviae [Iaşi], vol. IV, 2012, 546 pp. (editor-in-chief).
5. Archiva Moldaviae [Iaşi], vol. V, 2013, 608 pp. (editor-in-chief).
6. Archiva Moldaviae [Iaşi], vol. VI, 2014, 632 pp. (editor-in-chief).
7. Archiva Moldaviae, Supliment I, Studii de istorie socială. Noi perspective (coordonatori: Constantin Iordachi, Alin Ciupală), [Iaşi], 2014, 170 p. (editor-in-chief).

Cataloage de expoziție

1. Catalogul expoziţiei 130 de ani de la stabilirea relaţiilor diplomatice dintre România şi Marea Britanie, Franţa şi Germania, Bucureşti, Arhivele Naţionale ale României, 31 martie-28 mai 2010 (co-coordonator al expoziției); și textul introductiv – „Expoziţia 130 de ani de la stabilirea relaţiilor diplomatice dintre România şi Marea Britanie, Franţa şi Germania”, pp. 11-12 (împreună cu Stelian Obiziuc).
2. Catalogul expoziţiei Cedarea Basarabiei, a nordului Bucovinei şi a ţinutului Herţa (iunie 1940) – între neputinţă şi iresponsabilitate. O perspectivă românească, Bucureşti, Arhivele Naţionale ale României, 21 septembrie-22 decembrie 2010 (co-coordonator al expoziției); și textul introductiv – „Cedarea Basarabiei, a nordului Bucovinei şi a ţinutului Herţa (iunie 1940). O relectură a unui moment istoric controversat”, pp. 2-5; expoziția a fost prezentată și pe DVD.
3. Catalogul expoziţiei Viaţa urbană în Moldova şi Muntenia, 1830-1916, Bucureşti, Arhivele Naţionale ale României, 10 ianuarie-10 iunie 2012 (co-coordonator al expoziției); și textul introductiv – „Transformarea spaţiului urban în Moldova şi Muntenia, 1830-1916”, pp. 1-9.

Studii

1. „Dările în Moldova epocii fanariote” (I), în Acta Moldaviae Meridionalis. Anuarul Muzeului Județean „Ștefan cel Mare” Vaslui, vol. XV-XX, II, 1993-1998, pp. 37-69; (II), vol. XX-XXIV, I, 2001-2003, pp. 215-234; (III), vol. XX-XXIV, I, 2001-2003, pp. 235-259.
2. „Începuturile rezistenţei armate anticomuniste în România”, în Anuarul Institutului de Istorie “A.D. Xenopol”, vol. XXXIV, 1997, pp. 111-136.
3. „Naţiune şi confesiune. Reflecţii asupra coabitării în spaţiul românesc”, în Xenopoliana, vol. V, 1997, nr. 1-4, pp. 84-90.
4. „Privilegiile fiscale în Moldova epocii fanariote” (I), în Suceava. Anuarul Muzeului Naţional al Bucovinei, vol. XXIV-XXV, 1997-1998, 2000, pp. 199-216; (II), vol. XXIX-XXX, vol. II, 2002-2003, pp. 35-62.
5. „Modificări în modul de impunere şi percepere a dărilor în Moldova epocii fanariote”, în Carpica, vol. XXVII, 1998, pp. 148–169.
6. „Note pentru o istorie a exilului politic românesc. Primul deceniu postbelic”, în Xenopoliana, vol. VII, 1999, nr. 1-2, pp. 134-141.
7. „Ajutorul Marelui Frate. Consilierii sovietici în România lui Gheorghe Gheorghiu-Dej”, în Analele ştiinţifice ale Universităţii “Alexandru Ioan Cuza” din Iaşi, Istorie, vol. XLVI-XLVII, 2000-2001, pp. 211-248.
8. „«Guvernul Naţional Român» de la Viena (1944-1945)”, în Anuarul Institutului de Istorie “A.D. Xenopol”, vol. XXXVIII, 2001, pp. 155-169.
9. „Colectivizarea, cote şi revolte ţărăneşti în vestul României (1949)”, în Anuarul Institutului Român de Istorie Recentă, vol. I, 2002, pp. 282-318.
10. „Transformarea socialistă a agriculturii, răscoalele ţărăneşti şi deportările din nordul Moldovei (1949)”, în Anuarul Institutului de Istorie “A.D. Xenopol”, vol. XXXIX-XL, 2002-2003, pp. 459-487.
11. „«Marea nedreptate». Ocupaţia sovietică şi deportarea germanilor din România în URSS (1945-1949)”, în Analele ştiinţifice ale Universităţii “Alexandru Ioan Cuza” din Iaşi, Istorie, vol. XLVIII-XLIX, 2002-2003, pp. 179-222.
12. „Vămile şi ocnele în Moldova epocii fanariote. Aspecte fiscale”, în Cercetări istorice (serie nouă), vol. XXI-XXIII, 2002-2004, pp. 199-206.
13. „Sfidarea Securităţii în Bucovina. Grupul de rezistenţă armată anticomunistă Gavril Vatamaniuc (1949-1958)”, în Revista de Istorie Socială, vol. VIII-IX, 2003-2004, pp. 363-412.
14. „«Un ‘23 august invers»? Tentativa de readucere a României în Axă (toamna 1944- primăvara 1945)”, în Anuarul Institutului Român de Istorie Recentă, vol. II, 2003, pp. 221-290.
15. „Peasants’ resistance against agrarian Policy of Romanian Labour Party in Northern Moldavia (1940). Documentary Perspectives”, în Strabon. Bulletin d’Information Historique [Iasi], tome I, Numero 1, Janvier-Juin 2003, pp. 59-63.
16. „Activity of the Romanian Christian Committee for the Defence of Religious Freedom and of Conscience (ALRC) (1978-‘80s). Reference contributions from private archives”, în Strabon. Bulletin d’Information Historique, Tome I, Numéro 2, Juillet-Décembre 2003, pp. 61-72.
17. „O catastrofă uitată: campania armatei române din 1916”, în Xenopoliana, vol. XI, nr. 3-4, 2003 (Memorie si uitare in istorie), pp. 143-157.
18. „Prestaţiile în muncă faţă de stat şi turci în Moldova epocii fanariote”, în Istros [Muzeul Brăilei], vol. XI, 2004, pp. 311-325.
19. „Fapte uitate: Iaşul şi rezistenţa anticomunistă (1946-1950)”, în Anuarul Institutului de Istorie “A.D. Xenopol”, vol. XLI, 2004, pp. 389-412.
20. „Un «front» puţin cunoscut: rezistenţa armată anticomunistă din nordul Moldovei (1948-1954)”, în Analele Ştiinţifice ale Universităţii “Al. I. Cuza” din Iaşi (serie nouă). Istorie, tom L, 2004, pp. 219-251.
21. „«Oamenii de pădure». Rezistenţa armată anticomunistă din nordul Transilvaniei (1945-1958)”, în “Anuarul Institutului de Istorie “George Bariţ” din Cluj-Napoca. Series historica, vol. XLIII, 2004, pp. 317-371.
22. „Bucovineni contra sovietici. Rezistenţa armată antisovietică/anticomunistă din Bucovina (martie-august 1944 – iulie 1946)”, în Anuarul Institutului de Istorie Orală, vol. V, 2004, pp. 123-182.
23. „Organizaţii şi grupuri de rezistenţă armată anticomunistă din zona Aradului (1948-1956)”, în Acta Transylvanica. Anuarul Centrului de Istorie a Transilvaniei, vol. I, 2004, pp. 171-202.
24. „Informatorii Securităţii în comunităţile religioase din centrul Moldovei (1950)”, în Arhiva Istorică a României, serie nouă, vol. I, nr. 1, 2004, pp. 223-232.
25. „Dinamica represiunii comuniste împotriva ţărănimii din România (1951-1959)”, în Arhiva Istorică a României, serie nouă, vol. I, nr. 2, 2004, pp. 253-267 (editor).
26. „Rezistenţa armată anticomunistă în Moldova: «Frontul Patriei» (1950-1951)”, în Însemnări ieşene, (I), anul I, nr. 2, decembrie 2004, pp. 59-60; (II), anul II, nr. 3, ianuarie 2005, pp. 61-63.
27. „Garda Albă” – o formaţiune de rezistenţă anticomunistă din estul Transilvaniei (1948-1949)”, în Pontes. Review of South East European Studies, [Chişinău], vol. II, 2005, pp. 125-135.
28. „Nesupunere în Bucovina. Grupurile de rezistenţă armată anticomunistă Cenuşă–Motrescu, Pătrăucean-Gherman şi Cenuşă-Pătrăucean (1948-1951)”, în Anuarul Institutului de Istorie “A.D. Xenopol”, vol. XLII, 2005, pp. 451-481.
29. „În numele libertăţii. Organizaţiile anticomuniste «Tinerimea Liberă» şi «T»” (1945)”, în Xenopoliana, vol. XIII, nr. 1-4/2005 [Liberalismul românesc. Tendințe, structuri, personalități], pp. 127-149. [preluare și în Liviu Brătescu, Ovidiu Buruiană (eds.), Liberalismul românesc. Tendințe, structuri, personalități, Iași, Editura Universității „Alexandru Ioan Cuza” din Iași, 2013].
30. „«Organizaţia Naţională Creştină de Luptă împotriva Comunismului, Partizanii României Mari» şi planul de răsculare a Banatului (1948-1949)”, în Analele Ştiinţifice ale Universităţii “Al. I. Cuza” din Iaşi (serie nouă). Istorie, tom LI, 2005, pp. 293-316.
31. „Sarcini ale Securităţii pe linia cultelor (1949-1950)”, în Arhiva Istorică a României, serie nouă, vol. II, nr. 1 (3), 2005, p. 228-237 (editor).
32. “Rezistenţa armată anticomunistă din Bucovina: «Gărzile Decebal» şi grupul Grigore Sandu (1949)”, în Memoria, nr. 51-52, 2-3/2005, pp. 33-48.
33. „Formaţiuni din rezistenţa armată anticomunistă în sudul Moldovei (1945-1958)”, în AIO – Anuarul Institutului de Istorie Orală, vol. VI, 2005, pp. 163-192.
34. „Rămăşiţele grupului Ion Uţă”: formaţiunile de rezistenţă din Banat conduse de fraţii Duicu, Dumitru Mutaşcu şi Dumitru Işfănuţ (1949-1954)”, în Annales Universitatis Apulensis. Series Historica, vol. 9/I, 2005, pp. 193-215.
35. „Lupta deschisă cu regimul comunist în Banatul de munte. Grupurile de rezistenţă armată conduse de Spiru Blănaru, Petru Domăşneanu şi Gheorghe Ionescu (1948-1950)”, în Acta Transylvanica. Anuarul Centrului de Istorie a Transilvaniei, vol. II, 2005, pp. 119-168.
36. „«Realizările» Securităţii pe linia cultelor (1949)”, în Arhiva Istorică a României, serie nouă, vol. II, nr. 2 (4), 2005, pp. 145-164.
37. „Tragedii personale şi colective în rezistenţa armată anticomunistă din Munţii Apuseni. Grupul Teodor Şuşman (1948-1957)”, în Revista de Istorie Socială, vol. X-XII, 2005-2007, pp. 299-329.
38. „Grupul bănăţean de rezistenţă Liviu Vuc-Ioan Beg (1948-1958)”, în Memoria, nr. 54, 1/2006, pp. 52-61.
39. „Grupul de rezistenţă al colonelului Ion Uţă şi încercarea de constituire a “Blocului Naţional” în Banat (1947/1948-1949), în Studii şi Materiale de Istorie Contemporană, vol. V, 2006, pp. 89-120.
40. „Grupuri „minore” din rezistenţa anticomunistă bucovineană (1948-1961)”, în Codrul Cosminului, nr. 12, 2006, pp. 179-194.
41. „«Frontul Apărării Naţionale. Corpul de Haiduci» în luptă contra regimului comunist în sud-estul Munţilor Apuseni (1948-1952)”, în AIO – Anuarul Insittutului de Istorie Orală, vol. VII, Cluj-Napoca, Presa Universitară Clujeană, 2006, pp. 140-182.
42. „Formaţiuni «minore» de rezistenţă anticomunistă şi fugari solitari din nordul Transilvaniei (1949-1958)”, în Annales Universitatis Apulensis. Series Historica, vol. 10/I, 2006, pp. 133-146.
43. „Anticommunist Resistance Groups [Leon Şuşman, Simion Roşa, Leon Şuşman-Simion Roşa] in Central Transylvania – The Apuseni Mountains (1948-1957)”, în Revue Roumaine d’Histoire, vol. XLV, nos. 1-4, Janvier-Décembre 2006, pp. 245-265.
44. „Rezistenţa anticomunistă din Crişana (1948-1951)”, în Studia Universitatis Babeş-Bolyai, Istorie, vol. 51, nr. 2, 2006, pp. 127-144.
45. „Formaţiunile «minore»” de rezistenţă anticomunistă din Banat, 1947/1948-începutul anilor ’60”, în Anuarul Institutului de Istorie “A.D. Xenopol”, vol. XLIII-XLIV, 2006-2007, pp. 549-571.
46. „Formaţiuni «minore» de rezistenţă anticomunistă din Muntenia (1948-1957)”, în Analele Ştiinţifice ale Universităţii “Al. I. Cuza” din Iaşi (serie nouă). Istorie, tom LII-LIII, 2006-2007, pp. 189-214.
47. „Câteva amenzi în Moldova epocii fanariote. Aspecte fiscale”, în Memoria Antiquitatis. Acta Musei Petrodavensis, vol. XXIV, 2007, pp. 507-512.
48. „Collectivisation et répression de la paysannerie en Roumanie, 1949-1962”, în Communisme [Paris, CNRS], no 91/92 – 2007, Dossier: Roumanie: un totalitarisme ordinaire, pp. 65-77.
49. „Rezistenţa armată anticomunistă din partea sud-estică a Munţilor Apuseni. Grupul Diamandi Ionescu sau “Muntele Băişorii” (1948-1950)”, în Memoria, nr. 58-59, 1-2/2007, pp. 146-152.
50. „Biografii neconvenţionale în istoria Holocaustului şi Gulagului din România. «Drepţi între popoare» şi luptători în rezistenţa armată anticomunistă, în Caietele Echinox, vol. 13, Gulag şi Holocaust, coordonator Ruxandra Cesereanu, Cluj-Napoca, 2007, pp. 168-175.
51. „Structuri militare ale «Guvernului Naţional Român» de la Viena (1944-1945)”, în Revista istorică, vol. XVIII, nr. 1-2, 2007, pp. 157-176.
52. „Rezistenţa armată anticomunistă din Muntenia. Grupurile Dumitru Apostol, Nicolae Diaconescu, Constantin Hocic, Şerban-Drăgoi şi Şerban-Voican (1948-1957)”, în Studii şi Materiale de Istorie Contemporană, vol. VI, 2007, pp. 67-83.
53. “Religie şi putere în România. Politica statului faţă de confesiunile (neo)protestante, 1919-1944”, în Studia Politica. Romanian Political Science Review, vol. VII, nr. 3, 2007, Actele Colocviului Biserici şi politică în societatea românească a secolului al XX-lea, pp. 583-602.
54. „Rezistenţa armată anticomunistă din Munţii Făgăraş – versantul nordic. „Grupul carpatin făgărăşan”/grupul Ion Gavrilă (1949/1950-1955/1956)”, în Anuarul Institutului de Istorie “George Bariţ” din Cluj-Napoca. Series historica, vol. XLVI, 2007, pp. 433-502.
55. „The Anti-Communist Armed Resistance on the Southern Slope of the Făgăraş Mountains and the Iezer Maountains. The Groups Led by Colonel Gheorghe Arsenescu and Lieutenant Toma Arnăuţoiu (1948-1960)”, (I), în Revista Arhivelor, vol. LXXXIV, nr. 3-4, 2007, pp. 249-272; (II), în Revista Arhivelor, vol. LXXXV, nr. 1, 2008, pp. 283-311; (III), în Revista Arhivelor, vol. LXXXV, nr. 2/2008, pp. 160-186.
56. „Istoriografie şi memorii concurente. Perspective asupra Pogromului de la Iaşi (28-30 iunie 1941)”, în Anuarul Institutului de Istorie “A.D. Xenopol”, vol. XLV, 2008, pp. 275-285.
57. „Rezistenţa armată anticomunistă din zona Aiud, centrul Transilvaniei. Grupul fraţilor Spaniol (1948-1951)”, în Memoria, nr. 62, 1/2008, pp. 28-31.
58. „Stalin şi pregătirea alegerilor din România anului 1946”, în Memoria, nr. 64-65, 3-4/2008, pp. 47-62 (preluare din revista 22, nr. 31, 29 iulie-4 august 2008, pp. 10-13).
59. „«Un balon minuscul»: «Mişcarea Naţională de Rezistenţă» (1945-1946)”, în Revista Istorică, (I), tom XIX, nr. 3-4/2008, pp. 321-354; (II), tom XIX, nr. 5-6/2008, pp. 451-496.
60. „Le rôle des conseillers soviétiques dans le processus de communisation de la Roumanie”, in Pierre-Yves Boissau (éd.), La Roumanie aux marches du monde slave, Slavica Occitania, vol. 27, 2008, pp. 89-106.
61. „Rezistenţa armată anticomunistă şi rezistenţa greco-catolică în centrul Transilvaniei. Organizaţia “Partizanii Regelui Mihai – Armata Secretă” (1948-1950)”, în Revista Arhivelor, vol. LXXXVI, nr. 1/2009, pp. 204-218.
62. „Ruine, lipsuri şi anarhie. Moldova şi Bucovina de sud în toamna anului 1944”, în Archiva Moldaviae, vol. I, 2009, pp. 227-243.
63. „Rezistenţa armată anticomunistă din Vrancea. Organizaţia „Vlad Ţepeş II” (1949-1950)”, în Colloquium politicum. Revistă semestrială de analiză pluridisciplinară a politicului, anul I, nr. 1/ianuarie-iunie 2010, pp. 101-142.
64. „A Brief History of Romanian Archive Access since 1989”, în Euxeinos, nr. 3/2012,    pp.18-25; http://www.gce.unisg.ch/~/media/Internet/Content/Dateien/InstituteUndCenters/GCE/Euxeinos%20Folder/Euxeinos%203_2012.ashx?fl=en
65. „O viaţă între lumi: Leon Volovici” [„A Life Between Worlds: Leon Volovici”], în Archiva Moldaviae, vol. III, 2011, pp. 409-422.
66. „«Cultele neoprotestante şi drepturile omului în România». Un memoriu din 1977”, în Archiva Moldaviae, vol. IV, 2012, pp. 351-402.

Capitole în cărţi

1. „Contribuţia presei la dizolvarea PNŢ”, în Analele Sighet, vol. 5, Anul 1947 – căderea cortinei, editor Romulus Rusan, București, Fundația Academia Civică, 1997, pp. 646-657.
2. „Rezistenţa armată anticomunistă la începutul republicii populare”, în Analele Sighet, vol. 6, Anul 1948 – instituţionalizarea comunismului, editor Romulus Rusan, București, Fundația Academia Civică, 1998, pp. 210-237.
3. „Rezistenţa armată anticomunistă în România: Receptare culturală (1945–1989)”, în Romanian Studies at the Turn of the Century, Iași, Oxford, Portland, The Center For Romanian Studies, 2000, pp. 123-131.
4. „Ocuparea Legaţiei RPR din Berna (februarie 1955) şi propaganda comunistă”, în Analele Sighet, vol. 8, Anii 1954-1960 – Fluxurile şi refluxurile stalinismului, editor Romulus Rusan, București, Fundația Academia Civică, 2000, pp. 963-976.
5. „Încheierea colectivizării agriculturii. Ultimul asalt împotriva ţărănimii”, în Analele Sighet, vol. 9, Anii 1961-1972 – Ţările Europei de Est între speranţele reformei şi realitatea stagnării, editor Romulus Rusan, București, Fundația Academia Civică, 2001, pp. 191-197.
6. „Legionarii şi guvernarea Ion Antonescu (1941-1944)”, în Romania: A Crossroads of Europe, Iaşi, Oxford, Palm Beach, Portland, The Center for Romanian Studies, 2002, pp. 199-230.
7. „Libertate religioasă şi contestare în România lui Nicolae Ceauşescu: Comitetul Creştin Român pentru Apărarea Libertăţii Religioase şi de Conştiinţă (ALRC)”, în Analele Sighet, vol. 10, Anii 1973-1989 – Cronica unui sfârşit de sistem, editor Romulus Rusan, București, Fundația Academia Civică, 2003, pp. 203-227.
8. „The Soviet Counsellors’ involvement in postwar Romanian repressive and military structures”, în Alexandru Zub, Flavius Solomon Oldrich Tuma, Jiri Jindra (eds.), Sovietization in Romania and Czechoslovakia. History, Analogies, Consequences, Iaşi, Editura Polirom, 2003, pp. 157-174.
9. „Macedo-românii şi rezistenţa armată anticomunistă din Dobrogea (1948-1952)”, în Leonidas Rados (ed.), Interferenţe româno-elene (secolele XV-XX), cu o prefaţă de Alexandru Zub, Iaşi, Fundaţia Academică “A.D. Xenopol”, 2003, pp. 233-275.
10. „Colectivizarea şi răscoalele ţărăneşti”, în Şcoala Memoriei 2004. Prelegeri şi discuţii de la a VII-a ediţie a Şcolii de Vară de la Sighet (5-13 iulie 2004), editor Romulus Rusan, Bucureşti, Fundaţia Academia Civică, 2004, pp. 60-89.
11. Dorin Dobrincu, Constantin Iordachi, „Introducere”, în Dorin Dobrincu, Constantin Iordachi (eds.), Ţărănimea şi puterea. Procesul de colectivizare a agriculturii în România (1949-1962), Cuvânt înainte de Gail Kligman şi Katherine Verdery, Iaşi, Editura Polirom, 2005, pp. 21-41.
12. „Persuasiune, temporizare şi coerciţie. Colectivizarea târzie în nordul Moldovei: cazul Darabani”, în Dorin Dobrincu, Constantin Iordachi (eds.), Ţărănimea şi puterea. Procesul de colectivizare a agriculturii în România (1949-1962), Cuvânt înainte de Gail Kligman şi Katherine Verdery, Iasi, Editura Polirom, 2005, pp. 320-345.
13. „Richard Wurmbrand’s tours in Great Britain and their international echoes (1968-1972)”, în Dennis Deletant (ed.), In and Out of Focus. Romania and Britain. Relations and Perspectives from 1930 to the Present, Bucharest, British Council Romania, Editura Cavallioti, 2005, pp. 139-162.
14. „«Arnota» – un grup de rezistenţă armată anticomunistă din Oltenia montană (1949)”, în Dumitru Ivănescu, Marius Chelcu (eds.), Istorie şi societate în spaţiul est-carpatic (secolele XIII-XX). Omagiu profesorului Alexandru Zub, Iaşi, Editura Junimea, 2005, pp. 431-451.
15. „Die Deportation Deutscher aus Rumänien in die UdSSR gegen Ende des Zweiten Weltkrieges”, în Migration im südöstlichen Mitteleuropa. Auswanderung, Flucht, Deportation, Exil im 20. Jahrhundert, Herausgegeben von Krista Zach in Verbindung mit Flavius Solomon und Cornelius R. Zach, München, IKGS Verlag, 2005, pp. 233-246.
16. „Colectivizarea agriculturii şi represiunea împotriva ţărănimii din România (1949-1962)”, în Ruxandra Cesereanu (coordonator), Comunism şi represiune în România. Istoria tematică a unui fratricid naţional, Iaşi, Editura Polirom, 2006, pp. 108-125.
17. „Rezistenţa armată anticomunistă din Vrancea: grupul Ion Paragină (1948-1949)”, în Cosmin Budeancă, Florentin Olteanu, Iulia Pop (eds.), Rezistenţa anticomunistă – cercetare ştiinţifică şi valorificare muzeală, Cluj-Napoca, Editura Argonaut, 2006, pp. 74-89.
18. „Rezistenţa armată anticomunistă din munţii României”, în Şcoala memoriei 2006. Prelegeri şi discuţii de la a IX-a ediţie a Şcolii de Vară de la Sighet (10-17 iulie 2006), editor Romulus Rusan, Bucureşti, Fundaţia Academia Civică, 2007, pp. 240-272.
19. „Organizaţii (mici) de rezistenţă anticomunistă în România anilor 1945-1947”, în Robert Fürtoş, Gheorghe Mihai Bârlea (coordonatori), Alegerile parlamentare din 19 noiembrie 1946. De la memoria colectivă la cercetarea istorică, Bucureşti, Fundaţia Academia Civică, 2007, pp. 47-61.
20. „Formaţiuni „minore” de rezistenţă anticomunistă din Oltenia (1948-1952)”, în In honorem Ioan Ciupercă. Studii de istorie a românilor şi a relaţiilor internaţionale, editori Lucian Leuştean, Petronel Zahariuc, Dan Constantin Mâţă, Iaşi, Editura Universităţii “Alexandru Ioan Cuza”, 2007, pp. 303-316.
21. „Gulagul lui Gheorghiu-Dej. Despre cifre şi locuri ale represiunii, suferinţă şi moarte, memorie şi cercetare”, studiu introductiv la Dorin Dobrincu (editor), Listele morţii. Deţinuţi politici decedaţi în sistemul carceral din România potrivit documentelor Securităţii, 1945-1958, Iaşi, Editura Polirom, 2008, pp. 7-62.
22. „Persuasion, Delay and Coercion. Late Collectivization in Northern Moldova: The Case of Darabani (Suceava Region)”, în Constantin Iordachi, Dorin Dobrincu (eds.), Transforming Peasants, Property and Power. The collectivization of agriculture in Romania, 1949–1962, Budapest, New York, Central European University Press, 2009, pp. 275-304.
23. „Historicizing a Disputed Theme: Anti-communist Armed Resistance in Romania”, în Vladimir Tismăneanu (ed.), Stalinism Revisited – The Establishment of Communist Regimes in East-Central Europe, Budapest, New York, Central European University, 2009, pp. 305-342.
24. Noua organizare administrativ-teritorială, în Sorin Bocancea, Daniel Șandru (coordonatori), Zece exerciții de „inginerie constituțională”, Iași, Editura Institutul European, 2013, p. 93-112 (împreună cu Flavius Solomon).
25. „The Collectivization of Agriculture in Romania, 1949–1962”, în Constantin Iordachi and Arnd Bauerkämper (eds.), The Collectivization of Agriculture in Communist Eastern Europe. Comparison and Entanglements, Budapest–New York, Central European University Press, 2014, p. 251-287 (împreună cu Constantin Iordachi).
26. „The Communist Take-Over and Land Collectivization in Romania. Chronology of Events, 1945–1962”, în Constantin Iordachi and Arnd Bauerkämper (eds.), The Collectivization of Agriculture in Communist Eastern Europe. Comparison and Entanglements, Budapest–New York, Central European University Press, 2014, p. 287-292 (împreună cu Constantin Iordachi).